Η θαλάσσια περιοχή γύρω από Σαμοθράκη, είναι μια από τις πλουσιότερες σε ολόκληρη τη Μεσόγειο, όσον αφορά τη θαλάσσια ζωή που φιλοξενεί συνδυάζοντας ένα μεγάλο εύρος άλλων δραστηριοτήτων, όπως θαλάσσιες αθλητικές δραστηριότητες, το υποβρύχιο ψάρεμα, οι καταδύσεις.

Οι ακτές της Σαμοθράκης είναι ολοκάθαρες, δαντελωτές, σκεπασμένες με λευκό «βότσαλο». Στη νότια πλευρά του νησιού κοντά στο Λάκκωμα σας περιμένει η Παχιά Άμμος, μια πανέμορφη παραλία σκεπασμένη με άμμο. Στη συνέχεια συναντάς τον εξωτικό Βάτο με τα πλατάνια και τα κρύα νερά, το Κρεμαστό με τον καταρράκτη που τα νερά του χειμώνα- καλοκαίρι πέφτουν αφρισμένα στη βαθυγάλαζη θάλασσα για να αντικρίσεις το μαγευτικό θέαμα των γεωλογικών σχηματισμών, που οι ντόπιοι αποκαλούν «της Γριάς τα Πανιά». Απέραντη η παραλία των Κήπων, με σκούρο γκριζόμαυρο βότσαλο, αποκαλύπτει μερικές από τις μυστικές ομορφιές της Σαμοθράκης.

Στην θάλασσα και τις ακτές ένας ολόκληρος άλλος κόσμος μας υποδέχεται με δελφίνια Delphinus delphis, θαλασσοκόρακες Phalacrocorax aristotelis και ελάχιστα άτομα μεσογειακής φώκιας Monachus monachus που βρίσκουν προσωρινό καταφύγιο στις νοτιοανατολικές απόκρημνες ακτές.